Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phox2bO35690 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phox2bO35690 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phox2bO35690 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phox2bO35690 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms