Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ColqO35348 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ColqO35348 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ColqO35348 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ColqO35348 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ColqO35348 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ColqO35348 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ColqO35348 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ColqO35348 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ColqO35348 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ColqO35348 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ColqO35348 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ColqO35348 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ColqO35348 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ColqO35348 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ColqO35348 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ColqO35348 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ColqO35348 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ColqO35348 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ColqO35348 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ColqO35348 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ColqO35348 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ColqO35348 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ColqO35348 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ColqO35348 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ColqO35348 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ColqO35348 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ColqO35348 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ColqO35348 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ColqO35348 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ColqO35348 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ColqO35348 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ColqO35348 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ColqO35348 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ColqO35348 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ColqO35348 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ColqO35348 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ColqO35348 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ColqO35348 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ColqO35348 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ColqO35348 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ColqO35348 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ColqO35348 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ColqO35348 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ColqO35348 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ColqO35348 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ColqO35348 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ColqO35348 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ColqO35348 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ColqO35348 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ColqO35348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ColqO35348 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ColqO35348 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ColqO35348 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ColqO35348 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ColqO35348 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ColqO35348 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ColqO35348 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ColqO35348 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ColqO35348 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ColqO35348 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ColqO35348 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ColqO35348 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ColqO35348 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ColqO35348 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ColqO35348 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ColqO35348 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ColqO35348 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ColqO35348 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ColqO35348 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ColqO35348 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ColqO35348 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ColqO35348 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ColqO35348 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ColqO35348 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ColqO35348 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms