Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEFVO15553 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEFVO15553 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEFVO15553 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEFVO15553 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEFVO15553 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEFVO15553 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEFVO15553 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEFVO15553 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEFVO15553 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEFVO15553 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEFVO15553 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MEFVO15553 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEFVO15553 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MEFVO15553 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEFVO15553 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEFVO15553 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEFVO15553 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEFVO15553 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MEFVO15553 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEFVO15553 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MEFVO15553 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEFVO15553 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEFVO15553 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEFVO15553 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEFVO15553 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEFVO15553 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEFVO15553 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEFVO15553 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEFVO15553 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEFVO15553 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEFVO15553 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEFVO15553 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEFVO15553 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEFVO15553 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEFVO15553 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEFVO15553 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEFVO15553 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEFVO15553 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEFVO15553 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEFVO15553 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEFVO15553 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEFVO15553 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MEFVO15553 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEFVO15553 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEFVO15553 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEFVO15553 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEFVO15553 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEFVO15553 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEFVO15553 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEFVO15553 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEFVO15553 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEFVO15553 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEFVO15553 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEFVO15553 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEFVO15553 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEFVO15553 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEFVO15553 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MEFVO15553 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEFVO15553 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEFVO15553 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEFVO15553 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEFVO15553 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEFVO15553 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEFVO15553 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MEFVO15553 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEFVO15553 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEFVO15553 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEFVO15553 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEFVO15553 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MEFVO15553 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEFVO15553 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEFVO15553 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEFVO15553 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEFVO15553 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEFVO15553 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms