Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLOCKO15516 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLOCKO15516 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLOCKO15516 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLOCKO15516 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms