Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOXO15266 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOXO15266 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOXO15266 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHOXO15266 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHOXO15266 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHOXO15266 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOXO15266 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOXO15266 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOXO15266 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOXO15266 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOXO15266 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOXO15266 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOXO15266 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOXO15266 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOXO15266 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOXO15266 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOXO15266 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOXO15266 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOXO15266 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHOXO15266 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHOXO15266 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOXO15266 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOXO15266 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOXO15266 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOXO15266 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOXO15266 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOXO15266 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOXO15266 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOXO15266 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOXO15266 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOXO15266 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOXO15266 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOXO15266 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOXO15266 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOXO15266 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOXO15266 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOXO15266 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOXO15266 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOXO15266 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOXO15266 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOXO15266 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOXO15266 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOXO15266 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOXO15266 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOXO15266 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOXO15266 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOXO15266 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOXO15266 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOXO15266 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOXO15266 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOXO15266 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOXO15266 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOXO15266 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SHOXO15266 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOXO15266 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOXO15266 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOXO15266 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOXO15266 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOXO15266 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOXO15266 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOXO15266 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOXO15266 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOXO15266 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms