Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACOX3O15254 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACOX3O15254 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACOX3O15254 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACOX3O15254 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms