Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IKBKBO14920 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IKBKBO14920 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IKBKBO14920 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IKBKBO14920 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKBKBO14920 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms