Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN7AO14910 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN7AO14910 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIN7AO14910 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN7AO14910 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms