Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCANO14594 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCANO14594 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCANO14594 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCANO14594 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCANO14594 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCANO14594 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCANO14594 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCANO14594 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCANO14594 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCANO14594 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCANO14594 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCANO14594 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCANO14594 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCANO14594 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCANO14594 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCANO14594 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCANO14594 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCANO14594 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCANO14594 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCANO14594 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCANO14594 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NCANO14594 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCANO14594 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCANO14594 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCANO14594 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCANO14594 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCANO14594 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCANO14594 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCANO14594 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCANO14594 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NCANO14594 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCANO14594 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCANO14594 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCANO14594 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCANO14594 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCANO14594 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCANO14594 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCANO14594 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCANO14594 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCANO14594 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCANO14594 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NCANO14594 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCANO14594 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCANO14594 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCANO14594 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NCANO14594 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCANO14594 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCANO14594 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCANO14594 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCANO14594 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCANO14594 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCANO14594 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCANO14594 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCANO14594 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCANO14594 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCANO14594 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCANO14594 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCANO14594 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCANO14594 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCANO14594 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCANO14594 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCANO14594 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCANO14594 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCANO14594 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCANO14594 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCANO14594 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCANO14594 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCANO14594 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCANO14594 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCANO14594 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCANO14594 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCANO14594 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCANO14594 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCANO14594 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCANO14594 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCANO14594 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms