Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID1AO14497 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID1AO14497 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1AO14497 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms