Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltbp2O08999 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ltbp2O08999 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ltbp2O08999 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ltbp2O08999 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp2O08999 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ltbp2O08999 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltbp2O08999 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ltbp2O08999 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp2O08999 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp2O08999 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltbp2O08999 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltbp2O08999 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltbp2O08999 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms