Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClockO08785 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClockO08785 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClockO08785 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ClockO08785 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClockO08785 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClockO08785 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClockO08785 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClockO08785 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClockO08785 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClockO08785 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClockO08785 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClockO08785 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClockO08785 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClockO08785 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClockO08785 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ClockO08785 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClockO08785 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClockO08785 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClockO08785 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClockO08785 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClockO08785 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClockO08785 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClockO08785 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClockO08785 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClockO08785 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClockO08785 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClockO08785 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClockO08785 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClockO08785 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClockO08785 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClockO08785 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClockO08785 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClockO08785 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClockO08785 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClockO08785 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClockO08785 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClockO08785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClockO08785 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClockO08785 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClockO08785 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClockO08785 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClockO08785 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClockO08785 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClockO08785 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClockO08785 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClockO08785 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClockO08785 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClockO08785 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClockO08785 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClockO08785 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClockO08785 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClockO08785 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClockO08785 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClockO08785 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClockO08785 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClockO08785 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClockO08785 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClockO08785 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClockO08785 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClockO08785 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClockO08785 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClockO08785 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClockO08785 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClockO08785 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClockO08785 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ClockO08785 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClockO08785 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClockO08785 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClockO08785 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClockO08785 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms