Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mesp2O08574 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mesp2O08574 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp2O08574 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp2O08574 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms