Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PIK3C2BO00750 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PIK3C2BO00750 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3C2BO00750 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PIK3C2BO00750 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIK3C2BO00750 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
PIK3C2BO00750 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms