Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3C2AO00443 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PIK3C2AO00443 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PIK3C2AO00443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PIK3C2AO00443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PIK3C2AO00443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms