Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TULP2O00295 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP2O00295 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP2O00295 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP2O00295 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TULP2O00295 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TULP2O00295 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP2O00295 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP2O00295 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP2O00295 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP2O00295 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TULP2O00295 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP2O00295 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP2O00295 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TULP2O00295 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP2O00295 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP2O00295 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP2O00295 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP2O00295 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TULP2O00295 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP2O00295 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP2O00295 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TULP2O00295 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TULP2O00295 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP2O00295 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP2O00295 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TULP2O00295 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP2O00295 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP2O00295 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP2O00295 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP2O00295 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TULP2O00295 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TULP2O00295 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP2O00295 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TULP2O00295 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP2O00295 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP2O00295 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP2O00295 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP2O00295 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP2O00295 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP2O00295 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP2O00295 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP2O00295 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP2O00295 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP2O00295 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP2O00295 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP2O00295 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TULP2O00295 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP2O00295 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP2O00295 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP2O00295 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP2O00295 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP2O00295 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP2O00295 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP2O00295 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP2O00295 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP2O00295 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP2O00295 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP2O00295 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP2O00295 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP2O00295 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP2O00295 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP2O00295 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP2O00295 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP2O00295 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP2O00295 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP2O00295 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP2O00295 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP2O00295 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP2O00295 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP2O00295 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP2O00295 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms