Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF4O00268 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF4O00268 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF4O00268 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF4O00268 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF4O00268 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF4O00268 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF4O00268 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF4O00268 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF4O00268 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF4O00268 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF4O00268 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF4O00268 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF4O00268 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF4O00268 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4O00268 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4O00268 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF4O00268 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4O00268 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4O00268 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4O00268 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4O00268 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4O00268 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4O00268 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4O00268 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4O00268 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4O00268 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4O00268 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4O00268 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4O00268 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4O00268 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4O00268 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4O00268 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4O00268 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4O00268 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4O00268 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4O00268 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4O00268 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4O00268 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4O00268 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4O00268 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4O00268 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4O00268 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4O00268 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4O00268 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4O00268 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4O00268 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4O00268 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4O00268 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4O00268 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4O00268 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4O00268 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4O00268 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4O00268 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4O00268 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4O00268 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4O00268 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4O00268 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4O00268 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4O00268 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4O00268 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4O00268 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4O00268 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4O00268 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4O00268 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4O00268 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4O00268 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4O00268 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4O00268 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4O00268 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4O00268 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF4O00268 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4O00268 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4O00268 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF4O00268 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4O00268 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF4O00268 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4O00268 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4O00268 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4O00268 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF4O00268 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms