Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD12O00232 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD12O00232 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD12O00232 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms