Protein–RNA interactions for Protein: L7N294

Gm8897, Predicted gene 8897 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8897L7N294 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8897L7N294 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8897L7N294 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8897L7N294 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8897L7N294 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8897L7N294 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms