Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm21962L7N280 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm21962L7N280 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm21962L7N280 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm21962L7N280 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21962L7N280 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21962L7N280 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms