Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QR89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QR89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QR89 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QR89 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QR89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3QR89 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3QR89 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3QR89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
J3QR89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3QR89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3QR89 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3QR89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QR89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QR89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QR89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QR89 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3QR89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QR89 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QR89 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QR89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3QR89 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3QR89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
J3QR89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
J3QR89 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QR89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QR89 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QR89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3QR89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3QR89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3QR89 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3QR89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QR89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3QR89 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QR89 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QR89 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3QR89 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms