Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28051J3QMA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28051J3QMA2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28051J3QMA2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.4 ms