Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC01387J3KSC0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01387J3KSC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01387J3KSC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms