Protein–RNA interactions for Protein: H8Y6P7

GCOM1, GRINL1A combined protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1H8Y6P7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GCOM1H8Y6P7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GCOM1H8Y6P7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCOM1H8Y6P7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCOM1H8Y6P7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GCOM1H8Y6P7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GCOM1H8Y6P7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms