Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf4bG5E8Z2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Taf4bG5E8Z2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf4bG5E8Z2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Taf4bG5E8Z2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Taf4bG5E8Z2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf4bG5E8Z2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms