Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Tubgcp6G5E8P0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tubgcp6G5E8P0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tubgcp6G5E8P0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tubgcp6G5E8P0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Tubgcp6G5E8P0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Tubgcp6G5E8P0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubgcp6G5E8P0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms