Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYNX1G3V0Z9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYNX1G3V0Z9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYNX1G3V0Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYNX1G3V0Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYNX1G3V0Z9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNX1G3V0Z9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNX1G3V0Z9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms