Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colca2F8VPY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Colca2F8VPY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colca2F8VPY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colca2F8VPY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colca2F8VPY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colca2F8VPY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms