Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp9yF8VPU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp9yF8VPU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp9yF8VPU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp9yF8VPU6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp9yF8VPU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms