Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28048F7BCN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28048F7BCN0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm28048F7BCN0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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