Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28305F6U473 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28305F6U473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms