Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf212F6TQD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf212F6TQD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf212F6TQD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf212F6TQD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms