Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm10477F6SW83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm10477F6SW83 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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