Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ankrd35E9Q9D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ankrd35E9Q9D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ankrd35E9Q9D8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ankrd35E9Q9D8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ankrd35E9Q9D8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd35E9Q9D8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd35E9Q9D8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd35E9Q9D8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd35E9Q9D8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ankrd35E9Q9D8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd35E9Q9D8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms