Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga10E9Q6R1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga10E9Q6R1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga10E9Q6R1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga10E9Q6R1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga10E9Q6R1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms