Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pi4kaE9Q3L2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pi4kaE9Q3L2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pi4kaE9Q3L2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pi4kaE9Q3L2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pi4kaE9Q3L2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pi4kaE9Q3L2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pi4kaE9Q3L2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pi4kaE9Q3L2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pi4kaE9Q3L2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms