Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm3893E9Q1I1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm3893E9Q1I1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm3893E9Q1I1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm3893E9Q1I1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3893E9Q1I1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm3893E9Q1I1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm3893E9Q1I1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gm3893E9Q1I1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm3893E9Q1I1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm3893E9Q1I1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm3893E9Q1I1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
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