Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ryr1E9PZQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ryr1E9PZQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ryr1E9PZQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms