Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Setd1aE9PYH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Setd1aE9PYH6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Setd1aE9PYH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Setd1aE9PYH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Setd1aE9PYH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Setd1aE9PYH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Setd1aE9PYH6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Setd1aE9PYH6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Setd1aE9PYH6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1aE9PYH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Setd1aE9PYH6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Setd1aE9PYH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Setd1aE9PYH6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms