Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5415E9PXF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5415E9PXF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5415E9PXF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5415E9PXF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5415E9PXF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5415E9PXF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5415E9PXF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5415E9PXF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5415E9PXF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5415E9PXF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms