Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sptbn4E9PX29 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn4E9PX29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn4E9PX29 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn4E9PX29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms