Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb3D3Z6J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb3D3Z6J4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb3D3Z6J4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms