Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930595D18RikD3Z642 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930595D18RikD3Z642 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930595D18RikD3Z642 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930595D18RikD3Z642 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms