Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa28D3Z1V9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa28D3Z1V9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms