Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ccdc6D3YZP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc6D3YZP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc6D3YZP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc6D3YZP9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc6D3YZP9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc6D3YZP9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc6D3YZP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms