Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam47eD3YWC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam47eD3YWC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam47eD3YWC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam47eD3YWC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam47eD3YWC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam47eD3YWC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47eD3YWC7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47eD3YWC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam47eD3YWC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms