Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700015F17RikD3YUK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700015F17RikD3YUK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700015F17RikD3YUK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700015F17RikD3YUK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms