Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms