Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsperg2C6KI89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Catsperg2C6KI89 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Catsperg2C6KI89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsperg2C6KI89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Catsperg2C6KI89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsperg2C6KI89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsperg2C6KI89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms