Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm17333C6EQI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm17333C6EQI3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm17333C6EQI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms